变异毒株是指病原微生物因突变或最终通过自然变异而衍生出的病原物。这种变异可能来源于细菌的生物本身，也可能来源于外源因素，比如抗生素选择的压力。变异的病毒有许多表现形式，其中最常见的是：
一、细菌的遗传变异: 在给细菌过多的抗生素压力下，它会出现遗传变异，出现抗性突变，从而形成全新的抗性毒株，从而形成了抗性细菌。其最常见的是外源药物耐受，例如青霉素、香蕉霉素、β-内酰胺类等。
二、病毒的遗传变异: 某些病毒会受到自然突变，出现变异后，它们可以抵抗抗病毒抗体的活性，出现变异的病毒可以有更强的致病潜力。
三、病原菌的免疫变异: 某些病原菌会针对人体的免疫系统进行改变，这些变异会导致登革热病毒、流感病毒、麻疹病毒等细菌抗体的失效。
四、病原菌的环境变异：某些病原菌在适宜的环境中变异，如此一来，它们可以获得更强的适应能力，从而抵御外界环境的改变。例如，细菌在不同的温度、酸碱度、光照和湿度等不同的环境中变异，从而产生了冷抗性菌等新的变异菌株。
变异毒株的出现给我们的病原微生物病毒研究和治疗带来很大的挑战，因为它们出现了抗药性，使抗微生物疗法变得无效，也使目前使用的抗菌药物变得无效。要有效防治变异毒株，就必须进行大量的研究，研发新药物，以有效地抵抗变异毒株对人体健康的伤害。
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