RPKM是Reads Per Kilobase per Million mapped reads的缩写,代表每百万reads中来自于某基因每千碱基长度的reads数。RPKM是将map到基因的read数除以map到基因组上的所有read数(以million为单位)与RNA的长度(以KB为单位)。在。

R是reads,F是fragments,因而对于单端测序来说,二者相同;对于双端测序,FPKM将两端的reads当作一个fragment,只计算比对到同一转录本的数量,所以有RPKM是FPKM两倍的情况
RPKM是衡量测序数据的什么值转录组数据中,RPKM是Reads Per Kilo bases per Million reads的缩写,代表每百万reads中来自于某基因每千碱基长度的reads数。转录是遗传信息由DNA转换到RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,转录是mRNA以及非编码RNA(。
基因中map和read是什么意思此处,map的意思是“比对到基因图上”;read是指测序出的一条序列,也称“读序”。正在做RNA seq?RPKM, Reads Per Kb per Million reads RPKM=(10的9次方×C)/(N×L)。RPKM为某基因的表达量,C为唯一比对到该。
RPKM TMM 怎么选择选RPKM。RPKM是Reads Per Kilobase per Million mapped reads的缩写,代表每百万reads中来自于某基因每千碱基长度的reads数。RPKM是将map到基因的read数除以map到基因组上的所有read数与RNA的长度。RNA-seq是二代测序技术中。
本文地址:百科知识频道 https://www.hkm168.com/zhibai/956164.html,易企推百科一个免费的知识分享平台,本站部分文章来网络分享,本着互联网分享的精神,如有涉及到您的权益,请联系我们删除,谢谢!



相关阅读








