根据社会生产活动历史发展的顺序对产业结构的划分，产品直接取自自然界的部门称为第一产业，对初级产品进行再加工的部门称为第二产业，为生产和消费提供各种服务的部门称为第三产业。这是世界上通行的产业结构分类，但各个国家的划分不尽一致。
北京的第一产业主要为农业、林业、牧业、渔业以及农林牧渔服务业。第二产业主要为工业和建筑业，其中工业包括采掘业、制造业、自来水、电力、蒸气、热水、煤气等产业。第三产业所含行业比较多，分为四大层次，第一层次为流通部门，包括交通运输业、邮电通讯业、商业饮食业、物资供销和仓储业；第二层次为生产和生活服务的部门，包括金融、保险业，地质普查业，房地产、公用事业，居民服务业、旅游业、咨询信息服务业和各类技术服务业等；第三层次为提高科学文化水平和居民素质服务的部门，包括教育、文化、广播电视事业，科学研究事业，卫生、体育和社会福利事业等；第四层次为社会公共需要服务的部门，包括国家机关、政党机关、社会团体，以及军队和警察等。
北京市第三产业发展迅猛，仅在2002-2004年略有下降，在2004-2005年剧增，此后一直保持上升趋势。自2000年以来，北京市第三产业占GDP比重就超过50%，为58.3%，在2016年该比重超过80%，为80.2%。
北京市第二产业发展滞缓，仅在2002-2004年处于上升趋势，其余年份均保持下降趋势，尤其在2004-2005年下降明显，在2016年该比重低于20%，为19.3%。
北京市第一产业在2000-2016年均低于4%，且一直保持下降趋势，在2010年之后该比重就低于1%。这主要是受北京发展模式的影响，北京市人口集聚，密度过大，但是土地面积较小，不具备发展第一产业的条件。
北京是我国政治文化中心，是国际交往中心，也是科技创新中心，具有着三千多年的历史，存在着众多世界闻名的旅游景点。随着全国乃至全球各地的优秀人才集聚于北京，众多大型企业集团纷纷在此创建公司总部或分部。这些都是北京大力发展第三产业的核心优势。随着经济社会的快速发展，工业企业生产所引发的生态环境问题越来越影响北京当地居民的日常生活，其所爆发的各类健康问题也越来越严重，这日益倍受居民和政府的关注。为此，政府采取大量措施对污染型工业企业进行关闭整顿。
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