日本国立大学由日本政府直接出资和运营，总数为86所（具体请参详《日本国立大学列表》）。全日本47个都、道、府、县每个县都至少有一所。日本综合排名前十的大学均为国立大学，其中有东京大学，京都大学，东京工业大学等世界顶尖的院校。此外，由于其学费是三类大学中最便宜的，国立大学深受广大考生欢迎，因此竞争也尤为激烈。大阪教育大学、政策研究大学院大学、奈良先端科学技术大学院大学等综合排名虽然不高，但在某些具体领域代表了教育最高水平的学校。
机构设置
大学里的“大学院”是实施研究生教育的机构，有硕士（学制2年）、博士（学制3年）学位授予权。有些学校硕士课程和博士课程分别设立，有些学校是合在一起设立，分博士课程前期2年，博士课程后期3年，前期课程2年也视为硕士课程。
“学部”是实施本科教育的机构，有学士学位授予权。本科一般4年，医科6年（含牙医、兽医，毕业后可直接报考4年制博士研究生课程）。
短期大学和高等专门学校只能实施大学专科教育，学制2-3年，颁发专科毕业证书，不能授予学位。
在学部和大学院里，除攻读学位的正规学生外，还有“旁听生”、“履修生”和“进修生”。这三类学生都不能获得毕业证书或学位证书，只有“履修生”修读的学分被承认。学部不招收“研究生”。
日本国立大学的优势
- 高度自主权
与中国的大学各方面都受制于政府部门不同，日本的大学拥有高度自治权，并且学术自由，受到日本宪法保护（日本国宪法第23条）。不只是私立大学，国立、公立大学也不例外。因为大学的高度自治，所以哪怕日本的执政党是右翼势力，留学生也不需要太担心自己的求学之路会受到干扰。
- 诺贝尔奖的摇篮
作为全世界最权威、最有含金量的学术奖项，一个国家的诺贝尔奖获得者数可以成为衡量其教育水平的佐证。作为培育优秀学者的摇篮，日本23所诺贝尔奖获得者均来自国立大学，其中人数之最为东京大学和京都大学。
- 学费低
日本国立大学的学费统一为535,800日元一年。即使汇率大幅动荡，也能将换算后的学费稳定在3万人民币左右，其费用远低于与其同等层次的欧美大学及日本国内的私立大学。此外，国立大学的留学生很多能够享受学费半免的待遇，部分优秀的留学生还可以享受全免及奖学金待遇。
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日本国立大学列表清单 86所日本国立大学列表日文名称
中文名称
北海道大学
北海道大学
北海道教育大学
北海道教育大学
室兰工业大学
室兰工业大学
小樽商科大学
小樽商科大学
帯広畜产大学
带广畜产大学
旭川医科大学
旭川医科大学
北见工业大学
北见工业大学
弘前大学
弘前大学
岩手大学
岩手大学
东北大学
东北大学
宫城教育大学
宫城教育大学
秋田大学
秋田大学
山形大学
山形大学
福岛大学
福岛大学
茨城大学
茨城大学
筑波大学
筑波大学
筑波技术大学
筑波技术大学
宇都宫大学
宇都宫大学
群马大学
群马大学
埼玉大学
埼玉大学
千叶大学
千叶大学
东京大学
东京大学
东京医科歯科大学
东京医科齿科大学
东京外国语大学
东京外国语大学
东京学芸大学
东京学艺大学
东京农工大学
东京农工大学
东京芸术大学
东京艺术大学
东京工业大学
东京工业大学
东京海洋大学
东京海洋大学
お茶の水女子大学
御茶水女子大学
电気通信大学
电气通信大学
一桥大学
一桥大学
横浜国立大学
横滨国立大学
新潟大学
新潟大学
长冈技术科学大学
长冈技术科学大学
上越教育大学
上越教育大学
富山大学
富山大学
金沢大学
金泽大学
福井大学
福井大学
山梨大学
山梨大学
信州大学
信州大学
岐阜大学
岐阜大学
静冈大学
静冈大学
浜松医科大学
浜松医科大学
名古屋大学
名古屋大学
爱知教育大学
爱知教育大学
名古屋工业大学
名古屋工业大学
豊桥技术科学大学
丰桥技术科学大学
三重大学
三重大学
滋贺大学
滋贺大学
滋贺医科大学
滋贺医科大学
京都大学
京都大学
京都教育大学
京都教育大学
京都工芸繊维大学
京都工艺纤维大学
大阪大学
大阪大学
大阪教育大学
大阪教育大学
兵库教育大学
兵库教育大学
神戸大学
神户大学
奈良教育大学
奈良教育大学
奈良女子大学
奈良女子大学
和歌山大学
和歌山大学
鸟取大学
鸟取大学
岛根大学
岛根大学
冈山大学
冈山大学
広岛大学
广岛大学
山口大学
山口大学
徳岛大学
德岛大学
鸣门教育大学
鸣门教育大学
香川大学
香川大学
爱媛大学
爱媛大学
高知大学
高知大学
福冈教育大学
福冈教育大学
九州大学
九州大学
九州工业大学
九州工业大学
佐贺大学
佐贺大学
长崎大学
长崎大学
熊本大学
熊本大学
大分大学
大分大学
宫崎大学
宫崎大学
鹿児岛大学
鹿儿岛大学
鹿屋体育大学
鹿屋体育大学
琉球大学
琉球大学
政策研究大学院大学
政策研究大学院大学
総合研究大学院大学
综合研究大学院大学
北陆先端科学技术大学院大学
北陆先端科学技术大学院大学
奈良先端科学技术大学院大学
奈良先端科学技术大学院大学
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